La organización francesa de investigación agrícola y cooperación internacional CIRAD ha completado la secuenciación del genoma de la caña de azúcar, logrando descifrar su mapa genético.
Conocer el genoma de la caña de azúcar ha sido un gran desafío para los investigadores debido a su extrema complejidad, que comprende 10-12 copias de cada cromosoma, en comparación con el genoma humano, que solo tenía dos, dijo CIRAD el 10 de julio.
El equipo de CIRAD pudo refinar su descubrimiento utilizando el enfoque de la colinealidad – o alta similitud causada por numerosos genes que ocurren en el mismo orden en ambos genes – entre la caña de azúcar y el sorgo. El paralelismo entre las dos plantas permitió al equipo utilizar el genoma de sorgo como plantilla para ensamblar y seleccionar los fragmentos cromosómicos de la caña de azúcar para secuenciar.
«Gracias a este nuevo método, la secuencia de referencia obtenida para un cultivar de Réunion, R570, es de muy buena calidad», dijo Angélique D’Hont, genetista del CIRAD, quien coordinó el estudio.
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La secuencia de referencia fue un paso crucial para la secuenciación completa del genoma de la caña de azúcar y para analizar las variaciones entre diferentes cepas de caña de azúcar con mayor precisión.
D’Hont, quien vivió la misma experiencia con el genoma del banano en 2012, dijo que tener una secuencia de referencia para una especie «cambió radicalmente» todos los enfoques genómicos y genéticos para esa especie.
Con el genoma ahora desbloqueado, CIRAD informó que ahora podrá ser posible modernizar los métodos utilizados para desarrollar nuevas variedades de caña de azúcar en línea con la era de la biología molecular.
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Hasta ahora, los programas de mejora de cultivares de caña de azúcar se habían restringido a la hibridación y evaluaciones de campo extremadamente lentas y laboriosas.
Con la secuencia de referencia, las técnicas de cribado molecular para la caña de azúcar podrían desarrollarse para complementar las pruebas de campo, permitiendo la creación de nuevas variedades para aplicaciones más amplias, destacó el CIRAD.
La caña de azúcar era la fuente de casi el 80% del azúcar mundial, además de una gran participación en la producción de etanol y biomasa.
